List of IS606 copies in the Helicobacter pylori J99 genome

 

 

Name : IS606A Length : 1736 DR : 0 IR : 5/8 ORF A: 64(1412-1606(BC)
ORF B :442(355-1683)
IRL : TATCCCACTAGCACGAAAAACTCCGTCCTTTAGGGCGGAGATGTAAGTGC
IRR :GAAACCACCCCTTGCTAAAGCAAGGAGCTTCCTAACTAAAGCGCCCTAAT
Insertion site :
Sequence :
TATCCCACTAGCACGAAAAACTCCGTCCTTTAGGGCGGAGATGTAAGTGCATATCTGTTAGGTATTTGAATGTAA
TTCTACCTAGATCCATTCGCTTTTTAGCGCATTCTATTAAAAATCAAAGTTAGCTAGTTAATGCGGTGTTTCTTG
TTCTTGTATGTATTGCTTAATCATCTCTAAAGGCGTGCCCCCACAACTCCCAGCGAAATAACTAGGCGACCATAA
ATGCTTCCCCCACAAACTAGCCTCAACGCTTTTGAAATGGTGTTGTCTAGTCAAACGACTGCTAACGCCTTTTAA
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TACAAAACCCAAAAGAAATTAAACCAAGTCTTTGACAAGTCTAGTCATCAAAAAACAGACAGATACCATAAAATC
ACAAGCGAACTTTCAAAGCAATTTGAATTGATAGTAGTTGAAGATTTGCAAGTAAAAAACATGACTAAAAGAGCT
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TTTTTAGACTACAAACAACAGCATAATGGCAAATTGTTAGTGAAAGTTCCCCCACAATATACGAGTAAAACTTGC
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GAACACAGAGACATCAACGCTGCGAACAATATCTTAAGCAAAGGGTTAAGTCTTTTTGGGGTAGGAAATATCCAT
GCAGACTTTAAAGAACAAAGCCTTTCGTGTTAGTGTCCATTAGGGCGCTTTAGTTAGGAAGCTCCTTGCTTTAGC
AAGGGGTGGTTTC
Peptide :
ORF1 :
MSVSKLVNSLKGVSSRLTRQHHFKSVEASLWGKHLWSPSYFAGSCGGTPLEMIKQYIQEQETPH
ORF2 : MKVNKGFKFRLYPTKEQQDKLQHCFFVYNQAYNIGLNLLQEQYEKNKDLPPKERTRKKSSELDKAIKHHLNARGL
SFSSVIAQQSRMNVERALKDAFKVKNRGFPKFKNSKSAKQSFSWNNQGFFIKESDEERFKIFTLMKMPLMMCMHR
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