ISAax1

  • Family IS1202
  • Group IS1202
MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)
Accession numberTranspositionOriginHost
LR215048 ND Acholeplasma axanthum
Acholeplasma axanthum NCTC10138
DNA section
IS Length : 1530 bp

Ends


IR Length : 21/27

IRL : TGTGGTTATCTTATGATAATGTCTTAAGTAGTATCTTTTAATAATGTCCC
IRR : TGTCAATATCTTTTGAAAATGTCCTAAAAAAATAAGATCATTAACGTGAT

Insertion site


Left flankDirect repeatRight flankDR Length
TTAAATGCAAGAATCTTATTAATTACTTTTATTTTTTTCAACAAGTA27

DNA sequence

TGTGGTTATCTTATGATAATGTCTTAAGTAGTATCTTTTAATAATGTCCCAAACATTAGAAACTATAATACAATATTAAGTACTTAATATAATGGAGGTA
CTTAATGAGAAAGGTAGAACTAAAACCAATGGAACAAATGAAGTATGAAACAATAAAAAACTTAGTAACAAATAACGGTAATAAACTTAATGCTGCTAAT
AAACTAGGTATATCACTTAGACAAGTTAATAGATTAATTATCAAATATAATGAACAAGGTAAGGAAGGTTTTATTCATGGTAATAGAAAGAAGTCTCCTC
ACCTTATAATTAAAGTTGAAATCAAAAATAAAATTTTAAATTTATATAATAATAAATACTACAATTTCAACTTTAAACATTTTAAAGAAATGCTTCTGGA
AAATGAGAAAATTAAAATATCATATAATTCTCTATACAATCTCTTAGATGAAAATCTTATTTTATCACCAAAAGCTGAAAGAATTACTAAGAGGAAATAC
CGTGATAGAATTCAAACAAAAATAGATTTAAACGAATCCTTATCTATTCAAGAAAAGAATCTTATCATTGATAATAACATTTTAGATCCTAAAGATAATC
ACGCAAGACTTCCAAGAAAAAAATATGGTGGCGAGTTATTACAAATGGACGCATCAGAACATTTATGGTTTGGAGATAAAAAAACTCATCTTCATGCAGC
AATAGACGATGCTACAGGAATGTTAGTTGGTGCATATTTTGATCATCAAGAGACTCTAATTGGCTATTACAACGTTTTAAAGCAAACATTAGAGAATCAT
GGGATACCTAATGAGTTTCTAACTGACAGAAGAACAATCTTCGACTATAAATCATTAAAAAACCCTAAGCCCGAGTATAGTACATTAACACAATTTGGTT
ATGCCTGCGAGCAGCTGGGCATAACTTTAAATGTTACTTCTATTCCTCAAGCTAAGGGGCGAATTGAACGTTTATTTGGAACGTTACAATCCAGATTAAT
AAATGAGTTACGAATTAATAATATTAAGACCATCGTTCAAGCAAATGAGTTCCTACAATCATATCTTGATAAGTTTAATAAACAATTCTCTCTCATTAAT
GATAATATACCACAAGTTTACGAAAAGATTAATAGTGATACTGATTTAAACTTAATTTTAGCTGTTATATCTAGCCGTGTATTTGACCGTGGCTCTGCTT
TAAAGTATCAAAACAAGTATTTCCAAGCCTATAATAAAAATGGTAACTTAATGAACTTTAAACATCGTACAAAAGCTATAGTTATCAAATCATTTGATAA
TAAATTATATTGTTTAATTAACAGTGATTACTATAAATTAATTGAATTAGAATCTCACGAAAGTCATTCTAAAGATTTCGATCTTGGTGTTGAAAAAGAA
AAGAAAAAATACACTGTCCCTAATAGTCATCCATGGAAAAGTGATTCTTATAATCGGATGATAGAAAGAGCAATGTATAAATCACGTTAATGATCTTATT
TTTTTAGGACATTTTCAAAAGATATTGACA
Protein section
ORF number : 1

 

ORF 1
LengthBeginEndStrandFusion ORF
1386 bp461 aa1051490+No
ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

MRKVELKPMEQMKYETIKNLVTNNGNKLNAANKLGISLRQVNRLIIKYNEQGKEGFIHGNRKKSPHLIIKVEIKNKILNLYNNKYYNFNFKHFKEMLLEN
EKIKISYNSLYNLLDENLILSPKAERITKRKYRDRIQTKIDLNESLSIQEKNLIIDNNILDPKDNHARLPRKKYGGELLQMDASEHLWFGDKKTHLHAAI
DDATGMLVGAYFDHQETLIGYYNVLKQTLENHGIPNEFLTDRRTIFDYKSLKNPKPEYSTLTQFGYACEQLGITLNVTSIPQAKGRIERLFGTLQSRLIN
ELRINNIKTIVQANEFLQSYLDKFNKQFSLINDNIPQVYEKINSDTDLNLILAVISSRVFDRGSALKYQNKYFQAYNKNGNLMNFKHRTKAIVIKSFDNK
LYCLINSDYYKLIELESHESHSKDFDLGVEKEKKKYTVPNSHPWKSDSYNRMIERAMYKSR

 

Blast result :
Comments
ISAax1 is 65% aa similar to ISCul1.
References
1] Patricia Siguier (2020) Direct submission.
2] WTSI, Pathogen Informatics, Wellcome Trust Sanger Institute (2019) Direct submission.