ISAtba1

  • Family IS1202
  • Group ISTde1
MGE type ISRelated element(s) :
Isoform Synonym(s)
Accession numberTranspositionOriginHost
LGGA01000002 ND Atribacteria bacterium
Atribacteria bacterium 34_128
DNA section
IS Length : 1550 bp

Ends


IR Length : 27/36

IRL : TGTAATTAATCTGTGATATTGTCACCTTAAAATTAATCAGTAATAATGTC
IRR : TGTCAATAGTCAGTGAAAATGTCACCTTTAAGTTCAAAAATGATAATAAA

Insertion site


Left flankDirect repeatRight flankDR Length
TAACTCTAAAAAGATAATTTTCTAAAAA0
AAATTTTGTCAATAGTAATTTGCGCGGTTCCCCGTATCAGCTAA16

DNA sequence

TGTAATTAATCTGTGATATTGTCACCTTAAAATTAATCAGTAATAATGTCACTATGGAAAAGGTGAGATATCTAATGACCAAAAAAGAATTAGTAAGAGT
TCATGTCATCAAATCCCTAATTGAGGATAAGATGACCAGCAGGGATGCTGCGGAGGTTTTAAGCCTCAGCGAACGCCAGATAAAACGTCTAAAGGCAGGT
GTTAAAAAAGATGGCGAGGTGTTTGTTATCCACAAAAATAGAGGCCGTAAACCTAAGCATACTATCCCTGGTGAGATAAGAGACAAAATTGTTTTTCTTA
CTAGAAATAAATATGAAGGGGTAAATTATACCCATCTTGCAGAACTTTTAAGAGAACACGAAGGTATTAGCATTAGTCAGTCTTTTGTATCCAGAATCCT
TAAAGCCAAAGGTATCAAAAGTCCCAGAAAACACAGGCCACCTAAACCTCACCGCACGAGAGAACGTAAGCCTCAAGAGGGACTTTTATTGCAAATGGAT
GCCTCTCCTTATGAATGGATACCCGGCATAAAATGTTCTCTGCATGGGGCGATAGATGATGCCAGAGGAAATATAACCGGCCTTTATTTCTCTGAGAATG
AATGTTTAGACGGCTATTTCGCGGTTAAAAGACAGACCATTTTAGAATATGGTATACCGATGAGTATTTATGTAGACCAACATACTATATTTAAGGCACC
CAGTAATACCAAACTTACTATTTATGATGAGTTGGAAGCTAAAACTTTTGCTTATACCCAGTTTGGTAGGGCCATGCAGGAACTTTCCGTGGGGATAGTT
TATGCTCGTTCTCCTCAAGCTAAGGGTCGTATCGAAAGGTTATGGGAAACCTTACAGGATCGGTTAACCTTAGAGCTGCGTCTTGCTGGTATTAAATCTA
TTAAAGAAGCAAATGCCTTTCTTCCGGGATTTATCAAAAGGTTCAATGCCCGTTTCGCGGTAGTTCCCCGAGAGCCACAGTCTGCTTACCGGCCTTTAGA
GGAACATATTAATATAGATTATATACTGTGTAGGAAAGAGACTCGGAAAGCCAGCCATGGCTCTACTTTCTCTTTTGGAGGACAAACCTACCAGTTAAGT
AAAGATAACAAGGTAATATCTATACCTAATAAAGCTGCCATTACCGTATTGACCAGCCCTAGATTCGGTATGCGGGCAGAATATAAGGGTGGTGTTTACG
AAGTAAGAAAGGCGATTAAGCCTGCTAAAGTTATACCTAAGAAAGATAAGGTTAGAAGGTTCATAAAGGTTAAAGACGACCATCCCTGGAAAAACGGCAG
TCTAGAACCTAACTTCACTTACGAAGAAAGTGATAGGGAACTCGTTGCCGCTATCTATGACCCCAAAGGTTGGGAGTAGATAGCATATCTGCCAGGGGGC
ACCTTTTTCCCTGGCAGATCCCGGATGGTATGAGTTAATTTGATTTAAACTAATCCGCCCATAGAGAAGGCTAATAAAGTTTTTTGTTTCTTCCATCTTT
TTTATTATCATTTTTGAACTTAAAGGTGACATTTTCACTGACTATTGACA
Protein section
ORF number : 1

 

ORF 1
LengthBeginEndStrandFusion ORF
1305 bp434 aa751379+No
ORF function : Transposase
Chemistry : DDE

ORF sequence :

MTKKELVRVHVIKSLIEDKMTSRDAAEVLSLSERQIKRLKAGVKKDGEVFVIHKNRGRKPKHTIPGEIRDKIVFLTRNKYEGVNYTHLAELLREHEGISI
SQSFVSRILKAKGIKSPRKHRPPKPHRTRERKPQEGLLLQMDASPYEWIPGIKCSLHGAIDDARGNITGLYFSENECLDGYFAVKRQTILEYGIPMSIYV
DQHTIFKAPSNTKLTIYDELEAKTFAYTQFGRAMQELSVGIVYARSPQAKGRIERLWETLQDRLTLELRLAGIKSIKEANAFLPGFIKRFNARFAVVPRE
PQSAYRPLEEHINIDYILCRKETRKASHGSTFSFGGQTYQLSKDNKVISIPNKAAITVLTSPRFGMRAEYKGGVYEVRKAIKPAKVIPKKDKVRRFIKVK
DDHPWKNGSLEPNFTYEESDRELVAAIYDPKGWE

 

Blast result :
Comments
ISAtba1 is 66% aa similar to ISSsac1.
References
1] Patricia Siguier (2020) Direct submission.
2] Hu,P., Tom,L., Singh,A., Thomas,B.C., Baker,B.J., Piceno,Y.M., Andersen,G.L. and Banfield,J.F. (2016) MBio 7 (1), e01669-15.